Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRIP30626 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRIP30626 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRIP30626 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRIP30626 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRIP30626 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SRIP30626 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRIP30626 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRIP30626 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRIP30626 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRIP30626 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRIP30626 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRIP30626 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRIP30626 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRIP30626 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRIP30626 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRIP30626 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRIP30626 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRIP30626 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRIP30626 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRIP30626 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRIP30626 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRIP30626 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRIP30626 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRIP30626 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRIP30626 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRIP30626 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRIP30626 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRIP30626 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRIP30626 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRIP30626 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRIP30626 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRIP30626 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRIP30626 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRIP30626 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRIP30626 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRIP30626 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRIP30626 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SRIP30626 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms