Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCAP28676 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCAP28676 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCAP28676 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCAP28676 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCAP28676 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCAP28676 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCAP28676 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCAP28676 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCAP28676 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCAP28676 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCAP28676 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCAP28676 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCAP28676 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCAP28676 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GCAP28676 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCAP28676 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCAP28676 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCAP28676 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCAP28676 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCAP28676 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCAP28676 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCAP28676 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCAP28676 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GCAP28676 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCAP28676 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCAP28676 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCAP28676 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCAP28676 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCAP28676 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCAP28676 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCAP28676 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCAP28676 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCAP28676 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCAP28676 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCAP28676 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCAP28676 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCAP28676 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCAP28676 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCAP28676 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GCAP28676 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCAP28676 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCAP28676 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCAP28676 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCAP28676 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCAP28676 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCAP28676 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCAP28676 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCAP28676 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCAP28676 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCAP28676 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCAP28676 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCAP28676 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCAP28676 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCAP28676 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCAP28676 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCAP28676 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCAP28676 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCAP28676 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCAP28676 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCAP28676 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCAP28676 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCAP28676 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCAP28676 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCAP28676 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCAP28676 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms