Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCP20941 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCP20941 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCP20941 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCP20941 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCP20941 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCP20941 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCP20941 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCP20941 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCP20941 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCP20941 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCP20941 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCP20941 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCP20941 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCP20941 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCP20941 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCP20941 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDCP20941 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDCP20941 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PDCP20941 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDCP20941 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCP20941 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCP20941 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCP20941 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCP20941 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDCP20941 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDCP20941 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCP20941 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCP20941 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCP20941 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDCP20941 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDCP20941 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCP20941 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDCP20941 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCP20941 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCP20941 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCP20941 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCP20941 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCP20941 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCP20941 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCP20941 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDCP20941 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCP20941 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDCP20941 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCP20941 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDCP20941 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PDCP20941 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCP20941 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCP20941 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCP20941 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCP20941 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCP20941 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCP20941 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCP20941 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCP20941 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCP20941 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCP20941 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCP20941 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCP20941 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCP20941 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCP20941 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCP20941 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCP20941 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCP20941 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCP20941 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCP20941 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCP20941 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCP20941 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCP20941 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCP20941 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCP20941 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCP20941 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCP20941 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCP20941 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCP20941 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCP20941 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCP20941 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCP20941 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCP20941 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCP20941 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCP20941 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCP20941 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCP20941 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCP20941 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCP20941 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCP20941 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCP20941 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCP20941 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCP20941 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCP20941 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms