Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRHP20396 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRHP20396 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRHP20396 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRHP20396 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRHP20396 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRHP20396 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRHP20396 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
TRHP20396 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRHP20396 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
TRHP20396 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TRHP20396 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TRHP20396 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TRHP20396 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
TRHP20396 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRHP20396 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRHP20396 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
TRHP20396 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRHP20396 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRHP20396 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRHP20396 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRHP20396 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRHP20396 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRHP20396 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRHP20396 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRHP20396 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRHP20396 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRHP20396 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRHP20396 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRHP20396 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRHP20396 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRHP20396 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRHP20396 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRHP20396 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRHP20396 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
TRHP20396 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRHP20396 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRHP20396 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
TRHP20396 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRHP20396 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRHP20396 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRHP20396 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRHP20396 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRHP20396 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRHP20396 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRHP20396 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRHP20396 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRHP20396 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRHP20396 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRHP20396 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRHP20396 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRHP20396 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRHP20396 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRHP20396 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRHP20396 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRHP20396 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRHP20396 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRHP20396 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRHP20396 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRHP20396 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRHP20396 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRHP20396 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRHP20396 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRHP20396 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
TRHP20396 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRHP20396 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TRHP20396 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TRHP20396 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TRHP20396 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRHP20396 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRHP20396 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRHP20396 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRHP20396 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRHP20396 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRHP20396 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRHP20396 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRHP20396 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRHP20396 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRHP20396 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRHP20396 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRHP20396 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRHP20396 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRHP20396 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TRHP20396 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TRHP20396 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRHP20396 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRHP20396 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRHP20396 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRHP20396 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRHP20396 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRHP20396 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRHP20396 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRHP20396 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRHP20396 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRHP20396 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRHP20396 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRHP20396 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRHP20396 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRHP20396 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRHP20396 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms