Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD58P19256 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CD58P19256 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD58P19256 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD58P19256 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CD58P19256 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD58P19256 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD58P19256 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD58P19256 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD58P19256 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD58P19256 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD58P19256 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD58P19256 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD58P19256 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD58P19256 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD58P19256 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD58P19256 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD58P19256 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD58P19256 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CD58P19256 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD58P19256 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD58P19256 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CD58P19256 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD58P19256 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD58P19256 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD58P19256 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD58P19256 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CD58P19256 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CD58P19256 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD58P19256 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD58P19256 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD58P19256 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD58P19256 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD58P19256 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD58P19256 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD58P19256 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD58P19256 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD58P19256 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD58P19256 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD58P19256 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD58P19256 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD58P19256 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD58P19256 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD58P19256 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD58P19256 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD58P19256 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD58P19256 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD58P19256 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD58P19256 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD58P19256 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD58P19256 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD58P19256 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD58P19256 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD58P19256 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD58P19256 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD58P19256 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD58P19256 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD58P19256 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD58P19256 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD58P19256 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD58P19256 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD58P19256 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD58P19256 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD58P19256 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD58P19256 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD58P19256 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD58P19256 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD58P19256 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD58P19256 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD58P19256 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD58P19256 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD58P19256 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD58P19256 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD58P19256 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD58P19256 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD58P19256 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD58P19256 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD58P19256 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD58P19256 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CD58P19256 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD58P19256 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD58P19256 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD58P19256 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD58P19256 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD58P19256 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD58P19256 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD58P19256 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms