Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB1P16220 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB1P16220 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB1P16220 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB1P16220 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB1P16220 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB1P16220 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB1P16220 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB1P16220 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB1P16220 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB1P16220 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB1P16220 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB1P16220 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB1P16220 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB1P16220 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB1P16220 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB1P16220 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB1P16220 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB1P16220 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB1P16220 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB1P16220 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB1P16220 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB1P16220 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB1P16220 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB1P16220 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB1P16220 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB1P16220 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB1P16220 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB1P16220 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB1P16220 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB1P16220 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB1P16220 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREB1P16220 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREB1P16220 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CREB1P16220 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB1P16220 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB1P16220 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB1P16220 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB1P16220 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB1P16220 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB1P16220 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB1P16220 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB1P16220 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB1P16220 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB1P16220 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB1P16220 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB1P16220 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB1P16220 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB1P16220 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB1P16220 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB1P16220 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB1P16220 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB1P16220 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB1P16220 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB1P16220 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB1P16220 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB1P16220 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB1P16220 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB1P16220 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB1P16220 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB1P16220 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB1P16220 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB1P16220 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB1P16220 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB1P16220 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB1P16220 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB1P16220 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms