Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNAP12004 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNAP12004 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNAP12004 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNAP12004 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNAP12004 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNAP12004 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNAP12004 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNAP12004 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNAP12004 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNAP12004 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNAP12004 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNAP12004 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNAP12004 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNAP12004 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNAP12004 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNAP12004 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNAP12004 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNAP12004 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNAP12004 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNAP12004 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNAP12004 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNAP12004 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNAP12004 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNAP12004 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNAP12004 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNAP12004 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNAP12004 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNAP12004 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNAP12004 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNAP12004 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNAP12004 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNAP12004 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNAP12004 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNAP12004 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNAP12004 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNAP12004 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNAP12004 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNAP12004 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNAP12004 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNAP12004 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNAP12004 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNAP12004 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNAP12004 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNAP12004 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNAP12004 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNAP12004 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNAP12004 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNAP12004 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNAP12004 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNAP12004 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNAP12004 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNAP12004 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNAP12004 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCNAP12004 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNAP12004 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNAP12004 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNAP12004 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNAP12004 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNAP12004 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNAP12004 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNAP12004 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNAP12004 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNAP12004 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNAP12004 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNAP12004 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNAP12004 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNAP12004 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNAP12004 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNAP12004 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNAP12004 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNAP12004 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNAP12004 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNAP12004 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNAP12004 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNAP12004 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNAP12004 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNAP12004 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNAP12004 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNAP12004 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNAP12004 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNAP12004 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNAP12004 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNAP12004 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNAP12004 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNAP12004 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNAP12004 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNAP12004 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNAP12004 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNAP12004 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms