Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC1P11940 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PABPC1P11940 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC1P11940 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms