Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRM1P11229 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRM1P11229 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.8 ms