Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRFP10586 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms