Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCDC172P0C7W6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC172P0C7W6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms