Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPAP09012 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms