Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSLP07711 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSLP07711 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSLP07711 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSLP07711 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSLP07711 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSLP07711 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSLP07711 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSLP07711 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSLP07711 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSLP07711 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSLP07711 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSLP07711 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSLP07711 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSLP07711 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTSLP07711 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTSLP07711 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSLP07711 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSLP07711 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSLP07711 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSLP07711 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSLP07711 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSLP07711 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSLP07711 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSLP07711 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSLP07711 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSLP07711 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSLP07711 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSLP07711 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSLP07711 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSLP07711 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSLP07711 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSLP07711 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSLP07711 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSLP07711 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSLP07711 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSLP07711 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSLP07711 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSLP07711 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSLP07711 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSLP07711 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSLP07711 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSLP07711 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSLP07711 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSLP07711 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSLP07711 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTSLP07711 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTSLP07711 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSLP07711 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSLP07711 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSLP07711 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSLP07711 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSLP07711 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSLP07711 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSLP07711 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSLP07711 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSLP07711 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSLP07711 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSLP07711 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSLP07711 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSLP07711 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSLP07711 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSLP07711 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSLP07711 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSLP07711 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSLP07711 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSLP07711 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSLP07711 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSLP07711 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSLP07711 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSLP07711 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSLP07711 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSLP07711 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSLP07711 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSLP07711 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSLP07711 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSLP07711 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms