Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN13O95857 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN13O95857 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms