Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC6AO75865 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6AO75865 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6AO75865 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms