Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BANF1O75531 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BANF1O75531 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BANF1O75531 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BANF1O75531 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BANF1O75531 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BANF1O75531 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BANF1O75531 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BANF1O75531 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BANF1O75531 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BANF1O75531 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BANF1O75531 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BANF1O75531 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BANF1O75531 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BANF1O75531 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BANF1O75531 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BANF1O75531 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BANF1O75531 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BANF1O75531 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BANF1O75531 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BANF1O75531 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1327.3 ms