Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP1O75113 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP1O75113 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP1O75113 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms