Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENRO43583 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENRO43583 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENRO43583 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENRO43583 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENRO43583 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENRO43583 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENRO43583 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENRO43583 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DENRO43583 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DENRO43583 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENRO43583 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENRO43583 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENRO43583 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENRO43583 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENRO43583 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENRO43583 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENRO43583 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENRO43583 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENRO43583 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENRO43583 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENRO43583 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DENRO43583 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DENRO43583 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENRO43583 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENRO43583 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENRO43583 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENRO43583 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENRO43583 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENRO43583 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENRO43583 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENRO43583 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENRO43583 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENRO43583 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENRO43583 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENRO43583 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENRO43583 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENRO43583 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENRO43583 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENRO43583 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENRO43583 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENRO43583 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENRO43583 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENRO43583 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENRO43583 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DENRO43583 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DENRO43583 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DENRO43583 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DENRO43583 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DENRO43583 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DENRO43583 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DENRO43583 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DENRO43583 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DENRO43583 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DENRO43583 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DENRO43583 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DENRO43583 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DENRO43583 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DENRO43583 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DENRO43583 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DENRO43583 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DENRO43583 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DENRO43583 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DENRO43583 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DENRO43583 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms