Protein–RNA interactions for Protein: O14958

CASQ2, Calsequestrin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ2O14958 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASQ2O14958 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASQ2O14958 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms