Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DFFAO00273 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DFFAO00273 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DFFAO00273 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DFFAO00273 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DFFAO00273 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DFFAO00273 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DFFAO00273 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DFFAO00273 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFFAO00273 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFFAO00273 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DFFAO00273 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFFAO00273 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFFAO00273 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFFAO00273 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFFAO00273 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFFAO00273 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFFAO00273 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFFAO00273 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFFAO00273 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFFAO00273 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFFAO00273 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFFAO00273 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFFAO00273 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFFAO00273 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFFAO00273 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DFFAO00273 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DFFAO00273 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DFFAO00273 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DFFAO00273 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DFFAO00273 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DFFAO00273 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DFFAO00273 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DFFAO00273 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DFFAO00273 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFFAO00273 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFFAO00273 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFFAO00273 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DFFAO00273 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFFAO00273 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFFAO00273 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFFAO00273 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFFAO00273 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFFAO00273 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFFAO00273 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFFAO00273 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFFAO00273 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFFAO00273 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFFAO00273 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DFFAO00273 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFFAO00273 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFFAO00273 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFFAO00273 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFFAO00273 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFFAO00273 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFFAO00273 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFFAO00273 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DFFAO00273 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFFAO00273 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFFAO00273 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFFAO00273 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFFAO00273 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFFAO00273 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFFAO00273 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFFAO00273 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFFAO00273 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFFAO00273 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFFAO00273 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DFFAO00273 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DFFAO00273 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DFFAO00273 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DFFAO00273 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFFAO00273 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFFAO00273 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFFAO00273 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFFAO00273 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFFAO00273 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFFAO00273 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFFAO00273 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFFAO00273 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFFAO00273 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFFAO00273 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFFAO00273 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFFAO00273 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFFAO00273 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFFAO00273 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFFAO00273 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFFAO00273 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFFAO00273 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms