Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QQQ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QQQ9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QQQ9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QQQ9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QQQ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QQQ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QQQ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QQQ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QQQ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QQQ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QQQ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QQQ9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QQQ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QQQ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QQQ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QQQ9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QQQ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QQQ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QQQ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QQQ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QQQ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QQQ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QQQ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QQQ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QQQ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QQQ9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QQQ9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QQQ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QQQ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QQQ9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QQQ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QQQ9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QQQ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QQQ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QQQ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QQQ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QQQ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QQQ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QQQ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QQQ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QQQ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QQQ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QQQ9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QQQ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QQQ9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QQQ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QQQ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QQQ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QQQ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QQQ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QQQ9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QQQ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms