Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PQ18 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PQ18 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PQ18 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PQ18 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PQ18 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PQ18 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PQ18 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PQ18 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PQ18 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PQ18 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PQ18 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PQ18 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PQ18 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PQ18 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PQ18 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PQ18 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PQ18 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PQ18 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PQ18 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PQ18 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PQ18 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PQ18 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PQ18 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PQ18 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PQ18 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PQ18 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PQ18 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PQ18 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PQ18 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PQ18 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PQ18 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PQ18 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PQ18 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PQ18 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PQ18 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PQ18 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PQ18 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PQ18 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PQ18 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PQ18 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PQ18 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PQ18 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PQ18 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PQ18 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PQ18 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PQ18 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PQ18 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PQ18 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PQ18 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PQ18 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PQ18 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PQ18 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PQ18 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PQ18 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PQ18 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PQ18 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PQ18 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PQ18 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PQ18 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PQ18 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PQ18 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PQ18 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PQ18 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PQ18 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PQ18 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PQ18 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PQ18 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PQ18 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PQ18 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PQ18 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PQ18 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PQ18 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PQ18 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PQ18 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PQ18 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
E9PQ18 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PQ18 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PQ18 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PQ18 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PQ18 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PQ18 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PQ18 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms