Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM220BPB1ANY3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM220BPB1ANY3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM220BPB1ANY3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM220BPB1ANY3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM220BPB1ANY3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM220BPB1ANY3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM220BPB1ANY3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM220BPB1ANY3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms