Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN7Q9Y6W3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms