Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTP11Q9Y3A2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTP11Q9Y3A2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms