Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP20Q9Y2K6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP20Q9Y2K6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms