Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASF1AQ9Y294 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASF1AQ9Y294 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASF1AQ9Y294 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms