Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM50BQ9Y247 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM50BQ9Y247 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM50BQ9Y247 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM50BQ9Y247 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms