Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRPC5Q9UL62 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRPC5Q9UL62 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRPC5Q9UL62 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.14■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRPC5Q9UL62 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms