Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APPL1Q9UKG1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms