Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF11Q9UIL8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF11Q9UIL8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms