Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTNNA3Q9UI47 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA3Q9UI47 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms