Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDP1Q9P0J1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDP1Q9P0J1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms