Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DLL3Q9NYJ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DLL3Q9NYJ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms