Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZDHHC3Q9NYG2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC3Q9NYG2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms