Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRMT1Q9NXH9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms