Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COMMD8Q9NX08 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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