Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF19Q9NS68 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFRSF19Q9NS68 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms