Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPORSQ9NS56 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPORSQ9NS56 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOPORSQ9NS56 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1406.1 ms