Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SMYD2Q9NRG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD2Q9NRG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms