Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM9Q9NQV7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms