Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC177Q9NQR7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC177Q9NQR7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms