Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SARS2Q9NP81 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARS2Q9NP81 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARS2Q9NP81 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms