Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SP110Q9HB58 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP110Q9HB58 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP110Q9HB58 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms