Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHD4Q9H223 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHD4Q9H223 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHD4Q9H223 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHD4Q9H223 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHD4Q9H223 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHD4Q9H223 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHD4Q9H223 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHD4Q9H223 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHD4Q9H223 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EHD4Q9H223 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EHD4Q9H223 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EHD4Q9H223 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms