Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1EQ9GZS1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms