Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NDEL1Q9GZM8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDEL1Q9GZM8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms