Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms