Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MYD88Q99836 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
MYD88Q99836 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
MYD88Q99836 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYD88Q99836 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MYD88Q99836 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms