Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY1Q96T51 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
RUFY1Q96T51 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms